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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Biblioteca Rui Tendinha. |
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Data corrente: |
24/06/2019 |
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Data da última atualização: |
24/06/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PERON, F. N.; CALLONI, R.; VENTURA, J. A.; FERNANDES, P. M. B. |
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Afiliação: |
UFES; UFGRS; Jose Aires Ventura, Incaper; UFES. |
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Título: |
Bioinformatics approach to the study of the molecular behaviour of mealybug wilt of pineapple. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Acta Horticulturae, 1239, p. 177-184, 2019. |
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DOI: |
10.17660/ActaHortic.2019.1239.22 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Mealybug wilt of pineapple (MWP) is a disease caused by the Pineapple mealybug wilt-associated virus (PMWaV) complex transmitted by Dysmicoccus brevipes and D. neobrevipes. MWP symptoms are characterized by root dessication, leaf wilting and consequent failure to produce a fruit. The molecular mechanisms involved in the pineapple-PMWaV interaction for MWP symptomatology are still unclear. In this work, mRNAs of asymptomatic and symptomatic pineapple plants were evaluated using Illumina RNA sequencing technology. From a total of 79 million reads per sample, 16,097 genes were identified using STAR aligner and HTseq for paired-end files. Differentially expressed genes (DEGs) between the evaluated groups were estimated using DESeq2 and edgeR, with an FDR cutoff of ≤0.05. A total of 207 DEGs were detected, with 61 upregulated and 146 downregulated in symptomatic plants infected by PMWaV-2. The methodologies improved by the assays presented in this article and the detected DEGs can substantiate further researches with pineapple and the MWP disease. |
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Palavras-Chave: |
Abacaxi. |
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Thesaurus NAL: |
Bioinformatics; DESeq2; EdgeR; Pineapple; PMWaV; STAR; Transcriptomic. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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Registro original: |
Biblioteca Rui Tendinha (BRT) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Biblioteca Rui Tendinha. |
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Data corrente: |
19/01/2024 |
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Data da última atualização: |
07/02/2024 |
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Autoria: |
FORNAZIER, M. J.; KROHLING, C. A.; OLIVEIRA, R. F. de; ALIXANDRE, F. T.; VICOSI, D. B.; GUARÇONI, R. G. |
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Afiliação: |
Mauricio José Fornazier, Incaper; Cesar Abel Krohling, Incaper; Rodrigo Fernandes de Oliveira; Fabiano Tristao Alixandre, Incaper; David Brunelli Vicosi, Bolsista; Rogerio Carvalho Guarçoni, Incaper. |
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Título: |
Produtividade de variedades de café arábica em Mantenópolis, região noroeste do EspÃÂrito Santo. |
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Ano de publicação: |
2024 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO INCAPER PESQUISA, 3. , Vitória, ES. Produtividade de variedades de café arábica em Mantenópolis, região noroeste do EspÃÂrito Santo. Editores, Andréa Ferreira da Costa, Marlon Dutra Degli Esposti e Renato Corrêa Taques. Vitória, ES : Incaper, p. 27, 2024. |
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Páginas: |
p. 27 |
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Idioma: |
Português |
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Thesagro: |
Cafeicultura; Produção; Rendimento. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://biblioteca.incaper.es.gov.br/digital/bitstream/item/4560/1/Anais-SIP-2023-Final-Pag27.pdf
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Marc: |
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260 $aIn: SIMPÓSIO INCAPER PESQUISA, 3. , Vitória, ES. Produtividade de variedades de café arábica em Mantenópolis, região noroeste do EspÃÂrito Santo. Editores, Andréa Ferreira da Costa, Marlon Dutra Degli Esposti e Renato Corrêa Taques. Vitória, ES : Incaper, p. 27$c2024
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Registro original: |
Biblioteca Rui Tendinha (BRT) |
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